同治帝的死因争议颇多，大概有如下几种：
一、死于天花同治皇帝怎么死的。《国史旧闻》）濮兰德、巴克斯著慈德外记》载：“私家著述，皆谓太后纵帝游荡，及至得疾，又不慎重爱护，以至深沈不起，……盖帝常履饮于外，至翌晨召见军
机时犹未归也，或醉中言语失次，杂以南城猥贱之事，……一八七三年（即同治十二年）外间皆窃窃私议恐帝寿之不久。至次年十二月，帝得痘症，不能临朝，两宫
皇太后代执国政，月底帝遂降谕日：‘朕于本月有天花之喜，……’”。
二、死于花柳病。《桃花圣解庵日记》同治十三年甲戌十二月初五日记载：……嘻戏游宴，耽溺男宠，日就裸瘠，旋患痈，项腹各一，皆浓溃，日未昏，殆不知人。
正经史料里面还是天花之说比较靠谱。
至于同治的儿子，应该是没有。同治十九岁去世，要是有过出生夭折的孩子应该也有记录，像乾隆的七皇子，只有两岁也有排行。可是，凡事不能太绝对，在慈禧的威压之下，难说有没有秘密死亡的皇子。